Browse

Hierarchical exploration of TRG genes through taxonomy of Bacteria


Taxon name Taxon rank Species (n) Proteins (n) TRG genus (n) TRG species (n) Details
Vibrio aerogenes species 1 4,653 90 90
Vibrio aestivus species 1 5,461 146 70
Vibrio aestuarianus species 1 3,722 45 79
Vibrio agarilyticus species 1 3,797 45 116
Vibrio albus species 1 3,793 51 66
Vibrio alfacsensis species 1 4,604 84 81
Vibrio algicola species 1 3,228 39 65
Vibrio alginolyticus species 1 4,576 59 36
Vibrio algivorus species 1 3,224 53 33
Vibrio anguillarum species 1 3,731 48 48
Vibrio aphrogenes species 1 2,936 28 21
Vibrio aquaticus species 1 4,057 59 55
Vibrio aquimaris species 1 4,034 102 61
Vibrio artabrorum species 1 3,859 61 47
Vibrio astriarenae species 1 4,259 41 116
Vibrio atlanticus species 1 4,426 96 25
Vibrio atypicus species 1 4,369 63 37
Vibrio azureus species 1 4,227 101 101
Vibrio barjaei species 1 5,110 134 29
Vibrio bathopelagicus species 1 4,935 104 33
Vibrio bivalvicida species 1 4,486 64 56
Vibrio blepharus species 1 990 2 15
Vibrio brasiliensis species 1 4,312 65 46
Vibrio breoganii species 1 4,110 85 229
Vibrio campbellii species 1 4,698 109 50
Vibrio caribbeanicus species 1 4,008 52 101
Vibrio casei species 1 3,871 46 101
Vibrio celticus species 1 4,907 101 31
Vibrio chagasii species 1 5,004 133 128
Vibrio chagasii_A species 1 4,516 110 20
Vibrio cholerae species 1 3,656 51 63
Vibrio cidicii species 1 4,777 86 102
Vibrio cincinnatiensis species 1 3,295 37 21
Vibrio cincinnatiensis_A species 1 3,279 44 35
Vibrio comitans species 1 3,970 100 92
Vibrio coralliilyticus species 1 5,158 97 59
Vibrio coralliilyticus_A species 1 4,570 88 136
Vibrio coralliirubri species 1 5,034 114 42
Vibrio cortegadensis species 1 4,077 62 70
Vibrio crassostreae species 1 5,060 139 32
Vibrio crassostreae_C species 1 4,312 88 22
Vibrio cyclitrophicus species 1 4,470 74 41
Vibrio cyclitrophicus_A species 1 4,773 110 31
Vibrio diabolicus species 1 4,846 77 61
Vibrio diazotrophicus species 1 4,276 63 43
Vibrio echinoideorum species 1 4,949 104 24
Vibrio europaeus species 1 5,024 120 50
Vibrio ezurae species 1 3,260 74 39
Vibrio fluvialis species 1 4,443 66 38
Vibrio fortis species 1 4,515 75 68
Vibrio fortis_A species 1 4,701 75 35
Vibrio fujianensis species 1 3,321 35 30
Vibrio furnissii species 1 4,555 68 74
Vibrio galatheae species 1 3,746 48 56
Vibrio gallaecicus species 1 4,441 70 53
Vibrio gallicus species 1 3,109 47 50
Vibrio gangliei species 1 3,320 46 65
Vibrio gazogenes species 1 4,119 98 63
Vibrio gazogenes_A species 1 4,228 129 52
Vibrio gigantis species 1 5,077 153 42
Vibrio halioticoli species 1 3,571 79 58
Vibrio hangzhouensis species 1 4,667 75 72
Vibrio harveyi species 1 5,055 85 53
Vibrio hepatarius species 1 4,468 70 115
Vibrio hepatarius_A species 1 4,300 49 30
Vibrio hepatarius_B species 1 4,389 99 124
Vibrio hibernica species 1 3,146 37 36
Vibrio hippocampi species 1 4,032 62 79
Vibrio hyugaensis species 1 4,923 114 43
Vibrio ichthyoenteri species 1 4,519 119 145
Vibrio injensis species 1 3,285 54 27
Vibrio inusitatus species 1 3,858 97 56
Vibrio ishigakensis species 1 4,322 78 100
Vibrio japonicus species 1 3,862 47 44
Vibrio jasicida species 1 5,509 123 80
Vibrio kanaloae species 1 3,998 71 25
Vibrio katoptron species 1 920 3 8
Vibrio lentus species 1 5,140 142 30
Vibrio lentus_A species 1 5,093 133 71
Vibrio litoralis species 1 3,444 55 35
Vibrio madracius species 1 6,294 207 136
Vibrio maerlii species 1 4,244 46 56
Vibrio mangrovi species 1 4,327 70 55
Vibrio marinisediminis species 1 4,405 48 120
Vibrio marisflavi species 1 4,360 78 117
Vibrio maritimus species 1 6,558 191 126
Vibrio maritimus_A species 1 6,656 195 87
Vibrio maritimus_B species 1 5,373 100 148
Vibrio mediterranei species 1 5,198 122 60
Vibrio metoecus species 1 4,024 60 31
Vibrio metoecus_B species 1 3,503 41 15
Vibrio metschnikovii species 1 3,370 39 33
Vibrio mexicanus species 1 5,205 117 72
Vibrio mimicus species 1 4,062 50 51
Vibrio mytili species 1 4,533 63 80
Vibrio natriegens species 1 4,589 84 46
Vibrio navarrensis species 1 3,958 59 30
Vibrio neonatus species 1 3,326 68 33
Vibrio neptunius species 1 4,754 109 73
Vibrio nereis species 1 3,750 40 22
Vibrio nigripulchritudo species 1 5,779 83 86
Vibrio nitrifigilis species 1 4,893 62 105
Vibrio ordalii species 1 3,208 56 37
Vibrio orientalis species 1 4,225 66 32
Vibrio ostreicida species 1 3,974 48 107
Vibrio ouci species 1 5,121 129 126
Vibrio owensii species 1 5,986 147 286
Vibrio pacinii species 1 3,892 65 34
Vibrio palustris species 1 3,340 35 43
Vibrio panuliri species 1 4,347 55 104
Vibrio parahaemolyticus species 1 4,556 57 35
Vibrio pectenicida species 1 4,053 107 58
Vibrio pelagius species 1 4,259 53 49
Vibrio penaeicida species 1 6,007 116 179
Vibrio penaeicida_A species 1 5,677 97 65
Vibrio plantisponsor species 1 4,034 53 34
Vibrio pomeroyi species 1 4,829 96 27
Vibrio ponticus species 1 4,179 54 31
Vibrio porteresiae species 1 4,876 94 76
Vibrio profundi species 1 4,666 58 54
Vibrio proteolyticus species 1 4,391 42 70
Vibrio quintilis species 1 5,204 118 118
Vibrio rarus species 1 3,399 54 61
Vibrio renipiscarius species 1 3,871 54 65
Vibrio rhizosphaerae species 1 3,877 71 54
Vibrio rhodolitus species 1 4,110 48 37
Vibrio rotiferianus species 1 5,028 97 87
Vibrio ruber species 1 4,044 99 48
Vibrio rumoiensis species 1 3,792 54 25
Vibrio rumoiensis_A species 1 3,096 25 30
Vibrio sagamiensis species 1 3,969 118 79
Vibrio salilacus species 1 3,288 51 24
Vibrio salinus species 1 4,058 45 89
Vibrio scophthalmi species 1 4,577 105 101
Vibrio sinaloensis species 1 4,098 56 21
Vibrio sinaloensis_B species 1 4,547 56 46
Vibrio sinaloensis_C species 1 3,653 51 23
Vibrio sinensis species 1 4,758 81 77
Vibrio sonorensis species 1 5,070 83 173
Vibrio sp000169995 species 1 5,350 136 45
Vibrio sp000171815 species 1 3,839 66 53
Vibrio sp000176715 species 1 3,948 50 62
Vibrio sp000287055 species 1 4,052 83 170
Vibrio sp000316985 species 1 5,253 113 20
Vibrio sp000960595 species 1 4,590 80 78
Vibrio sp001506075 species 1 4,086 88 69
Vibrio sp001635455 species 1 5,204 157 72
Vibrio sp001676025 species 1 3,184 48 40
Vibrio sp001874155 species 1 2,306 31 18
Vibrio sp002100145 species 1 3,847 59 41
Vibrio sp002342685 species 1 4,422 58 84
Vibrio sp002342735 species 1 4,609 44 77
Vibrio sp002563795 species 1 3,857 46 55
Vibrio sp002608565 species 1 3,820 60 48
Vibrio sp002812955 species 1 3,422 40 50
Vibrio sp002873335 species 1 4,551 77 79
Vibrio sp002873395 species 1 3,301 22 58
Vibrio sp002875705 species 1 4,765 146 61
Vibrio sp002877365 species 1 4,575 81 94
Vibrio sp004804295 species 1 4,388 47 67
Vibrio sp006124995 species 1 4,068 77 46
Vibrio sp007124475 species 1 2,425 36 26
Vibrio sp007858795 species 1 4,828 97 29
Vibrio sp011306175 species 1 2,869 33 43
Vibrio sp013113835 species 1 4,847 78 33
Vibrio sp013114545 species 1 4,119 63 64
Vibrio sp013114595 species 1 4,340 49 81
Vibrio sp013114625 species 1 4,453 77 44
Vibrio sp013369335 species 1 3,755 53 33
Vibrio sp013369385 species 1 3,968 56 37
Vibrio sp014596725 species 1 4,422 74 124
Vibrio sp014694375 species 1 3,272 49 30
Vibrio sp014694455 species 1 4,918 148 133
Vibrio sp015278125 species 1 4,349 57 32
Vibrio sp018222805 species 1 3,920 64 31
Vibrio sp018223135 species 1 4,268 74 27
Vibrio sp021726515 species 1 3,241 43 19
Vibrio sp022397915 species 1 4,303 76 29
Vibrio sp022397955 species 1 4,428 73 35
Vibrio sp022836845 species 1 3,910 50 79
Vibrio sp023145695 species 1 4,335 67 73
Vibrio sp023634645 species 1 4,329 82 147
Vibrio sp023634655 species 1 4,681 81 82
Vibrio sp023716565 species 1 4,476 40 106
Vibrio sp023716665 species 1 4,410 43 49
Vibrio sp903986855 species 1 4,233 41 44
Vibrio spartinae species 1 4,532 112 82
Vibrio splendidus species 1 5,099 114 64
Vibrio splendidus_F species 1 4,581 91 21
Vibrio splendidus_I species 1 4,961 159 50
Vibrio splendidus_J species 1 4,759 102 54
Vibrio superstes species 1 4,151 100 86
Vibrio taketomensis species 1 4,144 53 80
Vibrio tapetis species 1 5,147 85 114
Vibrio tasmaniensis species 1 4,314 92 42
Vibrio tasmaniensis_A species 1 4,982 154 55
Vibrio tetraodonis species 1 3,921 96 28
Vibrio thalassae species 1 4,784 111 85
Vibrio toranzoniae species 1 3,960 62 30
Vibrio tritonius species 1 4,578 78 65
Vibrio tubiashii species 1 5,036 122 46
Vibrio tubiashii_A species 1 3,776 41 31
Vibrio ulleungensis species 1 3,982 51 47
Vibrio variabilis species 1 5,655 134 74
Vibrio viridaestus species 1 4,414 52 97
Vibrio vulnificus species 1 4,349 69 43
Vibrio xiamenensis species 1 5,037 71 133
Vibrio zhugei species 1 3,666 48 63
Vibrio ziniensis species 1 4,195 65 52