Opis studiów
Zasadniczym celem studiów II stopnia na kierunku Bioinformatyka jest kształcenie specjalistów o wysokich kwalifikacjach, dysponujących wiedzą i umiejętnościami umożliwiającymi analizę i interpretację danych biologicznych i biomedycznych oraz przygotowywanie nowych metod i technik bioinformatycznych dla takich sektorów, jak biotechnologia, biologia molekularna i diagnostyka medyczna.
Kierunek łączy w sposób twórczy narzędzia biologii i informatyki w celu projektowania i przeprowadzania wielkoskalowych eksperymentów badawczych oraz wszechstronnej analizy wyników uzyskanych z badań genomicznych, transkryptomicznych, proteomicznych i biomedycznych. Ponadto absolwenci potrafią zaprojektować i skonstruować własne narzędzia informatyczne służące do rozwiązywania konkretnych problemów biologii molekularnej.
Kształcenie
- bioinformatyka sekwencji i analiza danych pochodzących z sekwencjonowania nowej generacji
- bioinformatyka strukturalna i analiza struktur biologicznych
- bioinformatyka systemowa, ewolucyjna i populacyjna
- projektowanie i tworzenie oprogramowania bioinformatycznego
Specjalności w ramach kierunku
Na kierunku nie wyodrębniono specjalności, jednak szeroka paleta przedmiotów fakultatywnych umożliwia studentom skoncentrowanie się na wybranych aspektach bioinformatyki – np. analizie danych genomowych, algorytmice czy bioinformatyce strukturalnej.
Sylwetka absolwenta
Absolwenci otrzymają tytuł zawodowy magistra i będą mieli możliwość podejmowania pracy w:
- krajowych i zagranicznych laboratoriach bioinformatycznych, diagnostycznych i badawczych, instytucjach naukowo-badawczych
- w przedsiębiorstwach zajmujących się tworzeniem i rozwojem oprogramowania bioinformatycznego (np. na potrzeby diagnostyki medycznej)
- w działach badawczo-rozwojowych firm farmaceutycznych zajmujących się m.in. poszukiwaniem nowych leków
- jednostkach doradczych i projektujących procesy biotechnologiczne
- instytucjach zajmujących się obsługą biologicznych i medycznych baz danych
- jednostkach administracji publicznej
Program studiów
| # | Nazwa przedmiotu | Prowadzący | Pkt. ECTS | Forma zaliczenia |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Metody statystyczne w bioinformatyce | prof. dr hab. Idzi Siatkowski | 6 | Egz. |
| 2 | Genomika | prof. dr hab. Wojciech Karłowski | 5 | Egz. |
| 3 | Biologia strukturalna | prof. dr hab. Maciej Kozak prof. dr hab. Szymon Krzywda dr Michał Taube |
5 | Egz. |
| 4 | Analiza filogenetyczna | prof. dr hab. Jacek Dabert dr Eliza Głowacka |
5 | Zal. |
| 5 | Język angielski | - | 2 | Zal. |
| Przedmioty obieralne Punktów ECTS do uzyskania: 7 |
||||
| 1 | Wykłady eksperckie | Wydział Biologii | 1 | Zal. |
| 2 | Modelowanie zjawisk ekologicznych | prof. UAM dr hab. Jakub Kosicki | 3 | Zal. |
| 3 | Finansowe, prawne i etyczne aspekty funkcjonowania nauki | prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek | 2 | Zal. |
| 4 | Mikrobiologia | dr hab. Ryszard Koczura | 3 | Zal. |
| 5 | Molekularna diagnostyka środowiska | dr hab. Mirosława Dabert | 1 | Zal. |
| 6 | Projekt bioinformatyczny I | prof. UAM dr hab. Marek Żywicki | 3 | Zal. |
| # | Nazwa przedmiotu | Prowadzący | Pkt. ECTS | Forma zaliczenia |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Algorytmy uczenia maszynowego | dr Rafał Jaworski | 6 | Zal. |
| 2 | Bioinformatyka strukturalna | dr Jan Brezovsky | 3 | Egz. |
| 3 | Scientific Communication | prof. UAM dr hab. Mikołaj Olejniczak dr Savani Anbalagan |
2 | Zal. |
| 4 | Pracownia magisterska | - | 10 | Zal. |
| Przedmioty obieralne Punktów ECTS do uzyskania: 9 |
||||
| 1 | Wykłady eksperckie | Wydział Biologii | 1 | Zal. |
| 2 | Genomika medyczna | prof. dr hab. Paweł Zawadzki dr Alicja Woźna |
3 | Zal. |
| 3 | Rejestracja, przetwarzanie i analiza obrazów mikroskopowych | dr Anna Kasprowicz-Maluśki dr Tomasz Skrzypczak |
2 | Zal. |
| 4 | Projekt bioinformatyczny II | prof. UAM dr hab. Michał Szcześniak | 3 | Zal. |
| 5 | Zastosowanie chmury obliczeniowej w bioinformatyce | Radosław Januszewski | 2 | Zal. |
| 6 | Biologia systemowa | prof. dr hab. Borys Wróbel | 3 | Zal. |
| # | Nazwa przedmiotu | Prowadzący | Pkt. ECTS | Forma zaliczenia |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Transkryptomika | prof. UAM dr hab. Michał Szcześniak | 5 | Egz. |
| 2 | Seminarium magisterskie | - | 3 | Zal. |
| 3 | Pracownia magisterksa | - | 10 | Zal. |
| Przedmioty obieralne Punktów ECTS do uzyskania: 12 |
||||
| 1 | Wykłady eksperckie | Wydział Biologii | 1 | Zal. |
| 2 | Wirusologia | dr Jakub Barylski prof. UAM dr hab. Robert Nawrot |
2 | Zal. |
| 3 | Projekt bioinformatyczny III | dr Andrzej Zieleziński | 2 | Zal. |
| 4 | Biokrystalografia | prof. dr hab. Szymon Krzywda | 2 | Zal. |
| 5 | Uczenie maszynowe w przetwarzaniu danych molekularnych | Mariusz Ferenc | 3 | Zal. |
| 6 | Kreowanie innowacji i przedsiębiorczości | Seweryn Olek | 3 | Zal. |
| 7 | Psychologiczne mechanizmy zachowań człowieka | dr hab. Tomasz Hanć dr Sylwia Tramabacz-Oleszak |
3 | Zal. |
| # | Nazwa przedmiotu | Prowadzący | Pkt. ECTS | Forma zaliczenia |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Proteomika i metabolomika | dr Anna Baund | 3 | Zal. |
| 2 | Seminarium magisterskie | - | 7 | Zal. |
| 3 | Pracownia magisterksa | - | 14 | Zal. |
| Przedmioty obieralne Punktów ECTS do uzyskania: 6 |
||||
| 1 | Wykłady eksperckie | Wydział Biologii | 1 | Zal. |
| 2 | Metagenomika | dr Jakub Barylski prof. UAM dr hab. Ryszard Koczura prof. dr hab. Joanna Mokracka |
2 | Zal. |
| 3 | Struktura biomolekuł w roztworze | dr Michał Taube | 3 | Zal. |
| 4 | Wprowadzenie do głębokich architektur sieci neuronowych | Mariusz Ferenc | 3 | Zal. |
| 5 | Medycyna ewolucyjna | dr Mateusz Konczal | 3 | Zal. |